膽道結石和膽管結石的區別，廣義上膽道結石所指的範疇更廣，包括膽管結石及膽囊結石兩大部分。通常將膽道系統定義為肝內膽道、肝外膽道，肝外膽道包括左肝管、右肝管、肝總管、膽總管以及膽囊等部分，膽管通常只包括肝內膽管和肝外膽管。總體而言，如果排除膽囊結石，則膽道結石和膽管結石所指的範圍基本一致，其成因、治療的方案均無太本質的區別。

臨床上還是需要根據患者具體的檢查結果，以確定膽道或膽管結石的具體位置，才能確定具體的治療方案。臨床上患者的診斷也建議更精確到部位，比如膽管結石，需要精確是肝內膽管結石，還是膽總管結石，膽道結石也需要確定是膽囊結石，還是其它部位的結石。