膽管結石的危害主要是膽管結石引起的膽道梗阻、繼發炎症甚至有發生腫瘤的風險，根據膽管結石生長的部位可以分為肝內膽管結石和肝外膽管結石，具體如下：

1、肝內膽管結石：較小的肝內膽管結石可以沒有任何明顯症狀，伴隨著結石的增多，堵塞膽管會引起肝內膽管炎症或累及周圍的肝臟組織。由於反覆出現的肝內膽管炎症繼發細菌感染引起肝膿腫，或周圍肝組織纖維化、肝硬化，繼而可能增加肝內膽管細胞癌發生的風險；

2、肝外膽管結石：指結石位於肝總管或膽總管下段，膽汁排出受阻、膽管結石堵塞膽管會形成膽道擴張、梗阻性黃疸、膽汁反流入血，表現為皮膚、鞏膜黃染。如果合併有膽道的完全梗阻，患者會出現明顯的腹痛，繼而合併細菌感染，表現為寒戰、發熱，甚至出現感染中毒性休克的表現，臨床上稱為急性化膿性膽管炎，則需要儘早通過外科手術或介入來進行干預。