傳統的組織學病理靠細胞形態學進行分類和定義膠質瘤分級，臨床實踐中發現組織特徵相同或相似的膠質瘤可以預後差別很大，說明僅僅依靠組織學分型來分類膠質瘤尚有缺陷。研究表明，具有不同的分子學特徵，是相同組織學分型膠質瘤患者預後差異較大的原因。
　　基於分子病理的膠質瘤分型能夠更準確地分類、預判膠質瘤的臨床預後；並且對組織學上較難鑑別的混合性膠質瘤，如少突星形細胞瘤，還能幫助明確診斷和分級。新發現的分子變異有可能成為未來治療的新靶點。
　　經過多年的探索和積累，從2016年開始，膠質瘤的病理診斷已經進入分子診療時代，建立了以組織學分型和分子分型相結合的診斷模式（整合診斷）。整合診斷結合了膠質瘤的組織學特徵和分子分型，可以相對精準的分門別類膠質瘤，更好的指導治療和判斷預後，是目前診斷和分級膠質瘤的重要依據。
　　儘管進入分子診療時代已經數年，腦膠質瘤預後改善並沒有突破性進展，目前尚沒有明確有效的靶向藥物，免疫治療也是試驗階段。最大安全切除作為膠質瘤最主要的治療手段的地位尚未動搖，切除膠質瘤仍然需要本著除惡務盡的理念。儘管有研究說少突膠質細胞瘤可以不用激進的切除，因為放化療敏感；但是，安全前提下多切腫瘤還是收益更大，更託底，而且術前也不能100%準確預測少突膠質細胞瘤的診斷。從概率上講，少突膠質細胞瘤在所有膠質瘤中只是少數。
　　因此，分子診療時代，膠質瘤手術理念沒有變化，仍然是最大安全切除。