膽石症本身不管是膽囊結石或者肝內外膽管結石，最大問題就是影響膽汁排洩。因為肝臟和膽管分泌的膽汁主要進入腸道，幫助消化，如乳化脂肪組織，即進食油膩食物需膽汁酸鹽參與幫助其乳化。

膽管本身有膽道結石，又引起膽管炎症，造成膽管排洩功能異常，膽道不能充分引流或膽汁不能很好的進入腸道時，就可能造成消化道症狀，如厭油、食慾降低等，主要取決於病變本身對腸道功能的影響。