十二指腸鏡下取膽管結石有一定風險，在手術中的操作風險具體如下：

1、插管不成功，有時找不到開口，或者找到不容易插到膽管裡；

2、導致膽管炎，因為逆行插管會把細菌帶進去；

3、會造成急性胰腺炎，因為膽管和胰管是相通的，在插管過程中，會損傷或者導致胰腺水腫，術後導致急性胰腺炎；

4、取石過程中，往往需要切開十二指腸乳頭，會導致十二指腸乳頭的出血，罕見情況下會導致十二指腸壁穿孔；

5、取石過程往往會把十二指腸乳頭切開，切開之後長時間會有反流性膽管炎。

十二指腸鏡下取膽管結石是目前常用的一種微創取膽管結石的方法，其原理是通過口腔，通過胃，到達十二指腸，找到膽管開口，即十二指腸乳頭，然後逆行插管插到膽管裡，然後用網籃或者用氣囊，把石頭取出。