目前的醫療水平並沒有特別有效的藥物，能夠從根本上預防小腦萎縮的發生。但是通過控制高血壓、高脂血症、糖尿病、冠心病、酒精這一些危險因素，能夠減少患者發生小腦萎縮的風險。所以患者如果有這方面的危險因素，建議患者平時口服一些活血化瘀，改善腦部血液循環的藥物，預防小腦萎縮的發生。

臨床上通常用銀杏酮酯滴丸血塞通片、蛭蛇通絡膠囊、複方地龍膠囊、腦蛋白水解物片、奧拉西坦膠囊，改善腦供血，改善腦代謝，防止患者發生血管性的小腦萎縮症狀，同時患者要嚴格的控制血壓、血脂、血糖，這一些危險因素，避免吸菸、飲酒，加重患者腦動脈硬化這些問題。