乳腺囊腫可通過超聲提示，囊腫本身如果已經確定，是否需要做手術要根據其大小決定。並非一定要等到囊腫生長到很大時再去做手術，如果美觀對患者非常重要，可以選擇2cm以下做微創手術。如果美觀並不是非常重要時，患者可以選擇囊腫體積增大一些，甚至3cm、4cm時再進行手術。

以前認為乳腺囊腫由於沒有危害，所以一般不推薦病人進行手術治療。囊腫生長得較大時，醫生會建議病人進行手術治療。手術治療目的僅在於將囊腫進行完整去除，以免今後囊腫長大後需要付出更大的創傷或者影響乳腺美觀。

在乳腺囊腫長到2cm以上，患者需要進行開放性手術治療。如果病人對美觀非常在意，患者應該選擇囊腫體積在2cm內時選擇微創手術進行治療。如果病人對美觀並沒有很特別的要求，在3cm左右進行開放性囊腫切除手術較為合適。若病人囊腫為多發，不只有一顆囊腫時，醫生可根據囊腫位置和大小綜合判斷，儘量讓一個切口起到切除多枚囊腫的效果。因此在更大的囊腫或同部位存在更多的囊腫時，醫生會推薦進行此種囊腫的手術。