腦血栓是否會導致患者死亡，與血栓發生的部位及大小存在直接關係。不同粗細的血管發生血栓，患者的預後存在差異，若主幹血管發生大面積血栓，可能會導致患者死亡。而腦幹區域屬於大腦半球連接脊髓的部位，此處的人體生命中樞主管呼吸、心跳等基本生命活動，所以發生血栓的後果也較惡劣，甚至會導致患者死亡。

大腦血管的主幹血管行進到大腦後則會發生分支，而末梢的分支較多且較細。腦血栓則屬於嚴重的神經系統疾病，即大腦供應的血管發生堵塞，可以導致患者發生腦組織壞死而出現功能喪失。