腦血栓症狀由於發病機制不同，通常所表現的症狀不同。如果影響到語言功能區域，患者可能會出現語言功能障礙，可能會聽不懂別人講話，也可能自己講不出話，甚至完全性失語，也有可能表現為構音障礙，即講話時吐詞不清楚或出現吞嚥困難、飲水嗆咳、面癱等表現。部分患者可能還出現肢體障礙，如單側肢體乏力、疼痛、麻木等，出現走路不穩，行走時搖擺，都有可能為腦血栓的臨床表現。

腦部供血的每一塊腦組織都有相應的血管供血，腦內的每一個區域均對應一個特殊的功能。通常腦血管堵塞後可以導致該區域出現缺血的表現，繼發腦梗死後患者可以出現腦組織所支配的神經功能缺損的表現。