腦血栓嚴重與否，與其發生部位密切相關。若發生在關鍵部位，包括丘腦、基底核、尾狀核頭部、腦幹，這些部位只要發生梗死，後果會非常嚴重。若病人為腦幹的橋腦出現血栓，則會導致痴呆，最後預後不良。所以腦血管病是否嚴重與發生的部位密切相關，如果是關鍵的部位，可導致嚴重的後果。

此外，如果發生多次的輕微腦梗死，即腦梗死呈反覆發作，則累積起來後損害的腦細胞非常多。一個健康的人腦細胞為440億個，經一次短暫性的輕微腦梗後會有幾十億個腦細胞死亡。如果疾病反覆發作，會耗光腦細胞，從而使人變得痴呆。