腦血管畸形是神經外科治療難度比較大、手術風險比較高的一類疾病。手術之後有可能會遺留後遺症，這些後遺症的發生主要與腦部的缺血、出血等情況有關。通常表現為神經功能障礙相關的後遺症，比如肢體偏癱、偏身感覺障礙、偏盲等情況，以及可能會有癲癇發作。另外一些位於左側優勢半球血管畸形術後患者，可能會出現不同程度的失語表現。還有一些比較嚴重的腦血管畸形患者，術後可能會有不同程度的意識障礙，從淺昏迷、中昏迷到深昏迷，甚至植物生存狀態。

總體來說腦血管畸形，仍然是神經外科治療難度比較大的一類疾病。隨著這些年來雜交手術室的廣泛推廣，大部分腦血管畸形的手術相對比較安全，患者的安全性得到明顯提升，因此腦血管畸形術後後遺症的發生率也得到明顯下降。