顱咽管瘤為良性病變，治療以手術為主，在治療過程中要注意一些事項，比如圍手術期下丘腦的反應、尿崩症、容易引起電解質紊亂、小便紊亂等。較多顱咽管瘤的風險由下丘腦反應、電解質紊亂引起，而非手術所致。相對而言，顱咽管瘤在手術方面的風險較小。

整個顱咽管瘤的治療過程當中放療、化療不主要，如果能夠做到手術全切，平穩地度過圍手術期，顱咽管瘤即可治癒。對於一些復發的顱咽管瘤，可再次手術。