一般來說，顱咽管瘤是先天性腫瘤。從治療原則來講，只要發現顱咽管瘤就應該做手術。從自然病程來說，腫瘤要慢慢長大。第二是顱咽管瘤在腦子的中心部位，是長在很多神經和血管的間隙裡的一種腫瘤。

在腫瘤小的時候，手術相對容易，而且危險性小，損傷周圍的血管、神經的可能性小。隨著腫瘤增大，如果腫瘤太大，包繞周圍的神經、血管，甚至影響下丘腦等重要結構，手術切除腫瘤的難度會更大，還有風險會更大。同時會引起周圍神經、血管、下丘腦功能的障礙。

一般從治療原則來講，發現病人有顱咽管瘤，如果沒有絕對的禁忌症，都會建議病人儘早做手術治療。手術是顱咽管瘤唯一的治療方法，沒有藥物可以把顱咽管瘤吃好的，也不可能首選放療或伽瑪刀治療。