臨床中多數顱內腫瘤均需CT檢查進行初步篩查，再經核磁共振檢查做進一步判斷，但並不能通過一項檢查確診。對於顱咽管瘤，CT檢查尤為重要，因顱咽管瘤有CT特徵性的影像學表現，在腫瘤周邊可出現一圈鈣化，即蛋殼樣鈣化，但經核磁共振檢查不能發現此鈣化，是核磁共振檢查的弱項，所以並不能認為一種檢查完全可以替代另一種檢查。