室管膜瘤的病因其實並不是十分明確，室管膜瘤主要是由於室管膜細胞異常增殖形成的一種腫瘤，但是這種細胞這麼增殖的具體病因還不十分清楚。現在有一些研究顯示，可能和室管膜細胞本身發生的基因突變有關係，因為已經明確了一些和某些類型的室管膜瘤發生相關的基因突變。

除此之外，環境的因素，像常見的神經系統腫瘤的誘發因素，包括頭部電離輻射以及射線的輻射、磁場輻射、電場輻射，這些是否會明確誘發室管膜瘤的發生，還不十分明確。

除此之外，室管膜瘤患者還常見於神經腫瘤綜合徵的患者，這些神經腫瘤綜合徵一般是由明確的基因突變造成。所以，室管膜瘤發生在很大程度上是與患者的基因突變有一定關係，一些外界的環境的因素，可能是作為患者基因突變的一些誘發因素，或者腫瘤發生的一些促成因素。