高錳酸鉀可以用來治療龜頭炎，但只是治療的輔助手段，而不是主要手段，高錳酸鉀經過稀釋以後可以進行局部外洗或者浸泡龜頭，達到抑制局部細菌繁殖的作用。同時還需要配合口服抗菌藥物或者靜脈輸注抗菌藥物進行聯合治療，使用高錳酸鉀以後可以抑制局部細菌，也可以殺滅局部殘存的細菌，但是細菌已經造成的炎性反應，需要口服藥物或者靜脈輸注藥物進行治療。

單純使用高錳酸鉀溶液只能減輕局部症狀，並不能達到根治龜頭炎的目的。高錳酸鉀只適用於細菌感染所致的龜頭炎，對於真菌、滴蟲等感染所致的龜頭炎，高錳酸鉀治療效果較差或者無效，需要使用其它藥物來進行治療，比如真菌感染需要使用碳酸氫鈉溶液進行局部外洗，而滴蟲性龜頭炎需要使用甲硝唑溶液進行局部外洗。