龜頭炎可出現疼痛，疼痛主要侷限於炎症部位。龜頭炎可伴有龜頭和包皮局部的糜爛，出現龜頭和包皮部位的疼痛，並且伴有膿性或者白色絮狀的分泌物。控制炎症，黏膜逐漸癒合正常後，疼痛可逐漸緩解。

龜頭炎需要明確感染類型，進行針對性的治療才可及早治癒。大多由細菌感染引起，需要使用抗感染藥物。部分龜頭炎由真菌引起，通常抗生素治療無效，需要使用抗真菌藥物。少部分患者可能合併滴蟲性龜頭炎，需要進行抗滴蟲治療才可徹底治癒。龜頭炎完全治癒後，龜頭和包皮局部的疼痛可緩解和消失，但在急性期會出現疼痛症狀。