急性腸胃炎病情發展為急性過程，經過對因以及對症支持治療後，大部分急性腸胃炎患者，可以在短期內完全治癒，即徹底治癒。部分重症或者其他特殊病因所導致的急性腸胃炎，也可能會造成重症表現，常見治療方法如下：

1、對因治療：大部分急性腸胃炎與不潔飲食造成消化道感染有關，此時患者血液中可能會出現白細胞、中性粒細胞等反應炎症的細胞明顯增高，患者可以選擇抗生素針對炎症進行對因治療，針對消化道抗生素，比如頭孢類、喹諾酮。喹諾酮類消炎藥如左氧氟沙星，通常僅可用於成年人，避免對兒童骨骺發育產生影響；

2、對症治療：急性腸胃炎常表現為嘔吐、腹瀉症狀，可能導致部分體液丟失。此時補液較重要，如果能夠經口補液，即經消化道補液，屬於安全、較好方式。如果無法經口補液，可能需靜脈補液同時輔以對症治療，如選擇胃黏膜保護劑、黃連素、蒙脫石散等，吸附、收斂藥物改善腹瀉症狀。