急性尿道炎症通常推薦藥物是頭孢二代、三代以及喹諾酮類等藥物，包括常見頭孢地尼、頭孢噻肟、左氧氟沙星、諾氟沙星等。此類藥物主要針對急性泌尿系統感染治療，相應的細菌包括常見的大腸埃希菌、鏈球菌以及金黃色葡萄球菌等，且有明確治療效果。

部分患者是一個複雜的泌尿系統感染，同時可能會合並藥物耐藥情況出現。即反覆服用部分廣譜抗生素，總是無法緩解患者症狀，尿常規中的白細胞也長期處於陽性狀態。此時建議停藥一段時間後，進行尿培養檢測，即使用尿液做細菌培養，明確細菌類型，同時針對此細菌，使用藥物做藥敏試驗，明確具體敏感藥物。後續可選擇此種敏感藥物，進行足劑量、足療程治療，大部分患者可達到治癒目的。

病人治療期間務必多飲水，多排尿，保持良好的體質狀態。同時保持規律的性生活，儘量避免局部的不衛生，同房後也需大量喝水，迅速排尿，可沖刷尿道，避免病情復發。