陰莖口流膿首先考慮急性尿道炎，而急性尿道炎表現除陰莖口有分泌物以外，可能會出現一些排尿刺激症狀，如尿頻、尿急、尿痛。如果在這個基礎上還有流膿，需進行檢查，明確原發病的原菌感染。淋菌性尿道炎是造成尿道口流膿的重要因素，首先想到這個病以後，要塗片在顯微鏡底下染色，觀察是否為淋菌性尿道炎。在顯微鏡底下能看到一種革蘭氏陽性雙球菌，又稱奈瑟氏球菌，是造成急性淋病的致病菌。

淋病或者淋菌性尿道炎歸納為性接觸疾病，包括非淋菌尿道炎、淋菌性尿道炎、梅毒，甚至比較嚴重的艾滋病，一共歸納成10種性接觸疾病。淋菌屬於性接觸疾病，因為奈瑟氏雙球菌是造成淋菌感染的細菌，在自然環境下生存能力很差，離開人體潮溼的黏膜環境以後，在很短的時間內就會死亡。因此只有性接觸疾病才會造成淋菌蔓延、傳染和氾濫。所以，尿道口流膿一定要排除淋球菌感染引起的淋病。