便秘一般不會引起腰疼，除非患者的便秘較嚴重，導致不全或完全腸梗阻，俗稱腸道不通。此時由於氣體和糞便排出不通暢，氣體脹滿，導致腸管擴張，患者有可能會覺得後腰存在脹疼不適感。

另外，如果便秘並不是主要原因，而是繼發症狀，例如存在腹腔腫瘤、腸道痙攣、麻痺性腸梗阻，此時並不是由便秘導致，而是便秘本身也屬於繼發症狀，也有可能會引起腰疼。如果患者本身腰椎有問題，影響支配直腸，以及會陰區的感知神經末梢，這時實際上腰疼和便秘就是在相互影響，不代表便秘會引起腰疼，而是便秘會加重腰疼，腰疼又導致便秘進一步加重。