胃腸感冒患者會出現比較明顯的噁心、嘔吐、胃痛，患者腸絞痛、胃痛可以非常劇烈，表現為痙攣性、陣發性疼痛。當患者胃部疼痛比較嚴重的時候可以使用解痙藥，如顛茄片、654-2、阿托品等，可以在一定程度上緩解胃腸感冒引起的胃痛。

病毒感染可以導致胃黏膜損傷，所以也可以使用抑制胃酸的藥物；還可以使用保護胃黏膜的藥，達到緩解胃痛的作用。部分胃腸感冒患者本身可能存在慢性胃炎，這個時候使用胃黏膜保護劑也有利於緩解慢性胃炎所引起的症狀。