卵巢囊腫可以通過中藥進行治療，常用的中藥包括黃芪、丹參、香附、桃仁、鬱金等，這些中藥對於治療卵巢囊腫效果不錯，可以使卵巢囊腫變小甚至消除。

還可以通過口服中成藥進行治療，比如紅金消結膠囊、桂枝茯苓膠囊、金剛藤口服液等。

對於比較大的囊腫，如果超過4cm，通過服用中藥可能效果不是很好，需要通過手術進行治療，選擇的手術方式有輸卵管卵巢切除術、卵巢囊腫切除術等。