3-5天內出現的急性病程考慮急性胃腸炎，一般以病毒和細菌感染為主，病毒性的一般不需要干預，即可自愈，也可禁食1-2頓或使用蒙脫石散進行緩解；細菌性的可以通過查大便是否有白細胞，血常規裡白細胞是否升高等檢查來得到證實。細菌性胃腸炎，一般抗菌藥物使用後都可以得到完全治癒。

反覆的慢性病程建議進一步到醫院行結直腸鏡等相關檢查除外結直腸炎、結直腸癌等病變。如果是病毒引起的急性胃腸炎，一般都沒有特殊的處理。