細菌性的陰道炎，如果同時合併懷孕，對於胎兒以及孕婦都是有影響的，這個時候可以表現為陰道的分泌物增多、顏色發黃，並且有異味，還會出現外陰瘙癢。對於胎兒來說，容易出現上行感染和先兆流產，或者胚胎停止發育。這個時候可以應用甲硝唑進行陰道用藥治療，因為甲硝唑對於治療細菌性陰道炎效果還是很好的。

並且，甲硝唑外用在懷孕的早期，對胎兒不會造成影響。如果是在懷孕的其他時間引起的細菌性陰道炎，都可以應用甲硝唑局部用藥。懷孕超過3個月以後，應用甲硝唑口服也是安全的。