早孕反應晚上嚴重的原因有以下幾個方面：

1、與人體的生物鐘有一定的關係，因為在晚上體內的激素水平和白天會有明顯的不同，比如體內的雌激素、性激素、孕激素、黃體生成素、甲狀腺激素和去甲腎上腺素等，可以直接或間接作用於女性的生殖系統，從而導致孕反晚上比較嚴重；

2、因為神經系統的因素，因為女性在晚上有些神經系統的敏感性會增加，這些興奮的神經可以通過突觸而釋放神經遞質，間接地作用於女性的生殖系統，比如子宮、陰道和輸卵管，使這些器官的功能亢進或活躍性增強，也可以導致女性早孕反應在晚上嚴重。