十二指腸潰瘍絕大部分不會引發胰腺炎，胰腺炎是各種病因引起的胰腺炎性改變。常見的是膽源性胰腺炎，比如膽總管結石掉落，引起胰頭部、Vater壺腹部嵌頓，誘發胰腺炎。另外有酒精性胰腺炎、高血脂性胰腺炎等類型胰腺炎，有8-9類。處於前3位的是膽源性胰腺炎、高血脂性胰腺炎、酒精性胰腺炎，佔病因學的70%-80%。

十二指腸潰瘍主要在幽門螺桿菌感染，或者在藥物、酒精的刺激下引起十二指腸黏膜、黏膜下和黏膜肌層損傷，發病機制和胰腺炎基本不同。十二指腸潰瘍也會引起腹痛，如果是球后潰瘍，會有劇烈腹痛，胰腺炎也會有劇烈腹痛，症狀上有一定的相似性。