寶寶高燒40℃，3天不退燒，建議帶寶寶去醫院兒科就診，進行血液化驗及影像學檢查，明確導致發燒的原因，並對因治療，同時應輔助進行物理降溫。

寶寶發燒時，切忌給寶寶穿過多的衣服、蓋厚被，以免不利於散熱。同時應注意讓寶寶多喝水，避免脫水的同時也有助於散熱。可採取溫水擦浴的方式進行物理降溫，降低寶寶體溫。也可將冰袋外包裹毛巾放置在寶寶腋下、腹股溝等大血管流經處，降低體溫，但應注意時間不宜過長，每20分鐘更換一下部位。

另外，可在醫生指導下服用對乙酰氨基酚、布洛芬等藥物進行退熱處理，同時應警惕高熱驚厥的發生。如果是細菌或病毒感染導致的高熱，可遵醫囑加用抗炎和抗病毒的藥物等。如果為支原體感染，則需使用大環內酯類藥物進行治療。若為特殊疾病導致，則需根據檢查結果，積極治療原發病。