男性尿道炎多見於外部感染，最常見的原因便是通過性接觸感染，其次為包皮過長、包皮炎、龜頭炎或包莖。性生活過程中，女性尿道與陰道內炎症產生的分泌物、細菌，均可以逆行感染男性尿道，包括衣原體、支原體、鏈球菌及其他細菌，可經過性生活快速運動進入尿道，引起男性尿道炎症。

另外，龜頭、包皮、尿道口等局部的炎症刺激，同時喝水減少，可以使炎症向上擴散，引起尿道口炎症，再進一步引起尿道炎症，以上為臨床上較常見的2種情況。還有腎盂腎炎、膀胱炎、尿道炎、結石感染、結石等上尿路的炎症，也可在排尿過程中引起尿道炎症，還有由於前列腺炎症、前列腺細菌感染、排精或前列腺按摩，可以使細菌進入尿道，引起前列腺炎症。