膀胱結腸瘻是一種較難治療的疾病，如晚期乙狀結腸腫瘤很大，侵犯膀胱引起。治療前先要評估患者的一般狀況，通過影像學評估腫瘤能否一起切除。如果身體狀況允許，可以做一期切除，或者將腫瘤一起切掉，切掉膀胱可實現腫瘤的根治。

此外，還要關注膀胱結腸瘻侵犯的部位，即是否侵犯到輸尿管口、膀胱三角區等。如果患者的身體狀況較差，可先選擇近段腸管造瘻，或行遠端腸管封閉，改善患者的情況，然後再進行二期手術。