膀胱腫瘤根據腫瘤侵犯深度，分非肌層浸潤膀胱腫瘤較早期和肌層浸潤性膀胱腫瘤。一旦腫瘤侵犯到肌層，是較晚期腫瘤。非肌層浸潤性膀胱腫瘤進行保留膀胱手術，手後複發率較高，肌層浸潤性膀胱腫瘤術後會面臨轉移風險。非肌層浸潤性膀胱腫瘤患者的手術治療常保留膀胱，隨後再配合膀胱腔內灌注治療。如非肌層浸潤性膀胱腫瘤進行保留膀胱手術，則手後複發率較高。因此在術後配合膀胱腔內灌注化療或灌注免疫抑制劑，如卡介苗，目的是降低膀胱腫瘤術後複發率。

肌層浸潤性膀胱腫瘤的治療是根治性膀胱切除手術，用迴腸或腸道做排尿系統流出道改道，或腸道做原位膀胱，幫助患者儲尿和排尿，此類患者術後亦面臨轉移風險。如適合做膀胱全切，或適合根治性膀胱切除的患者，如早期實施此手術，轉移風險會大大降低。