結石粉碎後從體內的排出過程因人而異、因病而異。通常碎石需要達到粉末化狀態或達到碎塊化狀態才能保證後期排石成功。腎臟結石、輸尿管結石、膀胱結石均可以通過內鏡或體外碎石手段粉碎，粉碎程度需達到2-4mm以下。此類顆粒才能真正意義上為後續排石治療提供保障。一旦存在較大顆粒或較明顯的碎塊未被粉碎，還需進一步進行二次體外碎石或二次內鏡下碎石再加工。

整個碎石排石過程在臨床隨訪觀察中，以1-3個月療程為週期進行判斷。手術以後碎石排石需要根據患者總體條件隨訪跟蹤，可以結合水化，進行大量飲水、尿液沖刷。還可結合不同體育運動鍛鍊，跑步、跳繩，從而促進隨重力作用下的碎石排出。另外可以結合藥物排石以及物理排石床的輔助治療，加快碎石的排石週期。