陰莖短小可就診於泌尿外科或內分泌科。陰莖短小原因較多，具體如下：

1、陰莖海綿體發育較差，小陰莖需瞭解患兒體內垂體、腎上腺、睪丸軸、染色體及基因、睪丸分泌等情況。小陰莖需泌尿外科與內分泌科聯合診治；

2、如陰莖陷於海綿體內，可人為推出，則自身海綿體發育良好，需於泌尿外科就診，可考慮進行陰莖延長手術；

3、患兒體型肥胖：恥骨間脂肪較厚，需內分泌科跟進治療，更好控制體重。同時需泌尿外科協助診治，將包莖問題解決，使包皮翻出、及時清洗，可暫時不考慮手術治療。