主動脈間隔缺損主要表現為主動脈及肺動脈在胎兒早期形成的缺損，可造成主動脈向肺動脈大量分血，引起患兒肺內血過多，出現呼吸困難、肺動脈高壓、肺感染、呼吸困難、營養不良等症狀，甚至需上呼吸機進行治療。

因此主動脈瓣間隔缺損為嚴重心臟病，臨床上根據病情通常在疾病早期，甚至新生兒期需要進行治療。平時家長需注意孩子的呼吸狀況、吃奶時是否出汗、體重增長情況，若均表現不良，需儘快到醫院就診。

主肺動脈間隔缺損為非常嚴重的先天性心臟病，甚至在新生兒期需進行手術治療。主肺動瓣間隔缺損通常與嚴重的肺動脈狹、肺動脈閉鎖、大動脈轉位及梗阻性肺靜脈異位瘤相同，均為新生兒期急需處理的先天性心臟病。