主動脈內球囊反搏術的手術流程，類似於冠狀動脈內的介入治療。術前常規消毒、鋪巾，做好術前準備。手術的路徑是從右側股動脈開始，穿刺之後植入8F動脈鞘，在動脈鞘內把球囊送到降主動脈的靶血管處。球囊的尾端要接通氦氣，主導球囊的擴張和縮窄。另一側接壓力監測系統，壓力監測系統又會連接電子系統，可以監測病人的心律和壓力變化控制球囊起落。主動脈球囊反搏裝置連接好之後，醫生在X線下，把球囊緩慢送到降主動脈的靶血管處，通過調試看球囊的起落幅度，一般在心律或者壓力的指導下，醫生進行球囊的起落操作，減少心臟做功，以達到疾病治療的目的。