心臟黏液瘤手術必須在體外循環下進行，目前手術費用一般在3-5萬元之間。進行手術需要建立體外循環，可使用機器代替心臟和肺進行循環工作，在此種情況下，心臟停止運行，可打開心臟並找到腫瘤部位進行切除。手術以後再把心臟循環重新恢復，逐漸替代體外機器，待患者心臟自主跳動運行以後，則手術基本可以結束。手術過程較為安全，且時間相對較短，可以把腫瘤徹底切除。