先天性心臟病孕期是可以檢查出來的，隨著現在產前診斷技術迅速發展，大部分先心病可以通過產前超聲如四維彩超及胎兒心臟彩超檢查診斷出來。

胎兒心臟彩超可在超聲下觀察心臟的四個腔室、大血管有無結構畸形以及心臟的血流有無異常，目前是首選檢查方法。但是也有很多很小的異常，如室間隔、房間隔的微小缺損容易漏診，可以在分娩後行新生兒的心臟聽診以及心臟超聲檢查進行排除，比如房間隔、室間隔的微小缺損以及出生後動脈導管未閉這種畸形，隨著孩子長大是可以逐漸癒合的，即使未癒合也是很輕微的疾病，治療也相對非常簡單。