先天性心臟病患者的壽命，一般與所患先天性心臟病的種類有關。

複雜的先天性心臟病，如單心室、永存動脈幹、大動脈轉位、右室雙出口等，小孩生下來不到兩三歲可能會死亡。患法洛四聯症的小孩，經常會因為缺氧而出現猝死，一般壽命在十幾歲，但是也有活到20多歲的患者。患有房室管畸形、肺靜脈異位引流的小孩，很快就會出現肺動脈高壓，影響小孩的壽命。

簡單的先心病如動脈導管未閉、房間隔缺損、室間隔缺損等，臨床上成人比較常見，也有房間隔缺損、室間隔缺損活到50多歲的患者，但已經失去了手術的機會，生活質量較差。