先天性心臟病大多都為胎兒時帶出，即胎內帶出，室間隔缺損同樣如此，因為在心臟發育及室間隔形成的過程中沒有完全長好，具體原因如下：

1、在胎兒發育的早期，尤其是前3個月的時間，心臟早期形成過程中，如受到外界因素的干擾，最常見的感染，如細菌感染、病毒感染，多見於感冒，或者皰疹病毒感染、腮腺炎等，感染後會導致胎兒心臟發育受到影響；

2、母親年齡較大，現在二胎政策放開，母親年齡超過40歲胎兒容易出現心臟畸形；

3、母體年齡過小，臨床工作中也會遇見媽媽年齡很小，15-16歲，也容易出現室間隔缺損，母體本身還沒有長成熟時，後代可能也會有畸形；

4、汙染，最常見的家裡裝修，地板、牆面、傢俱，尤其室內小環境有甲醛，會影響孩子發育。室外大環境，空氣汙染，應考慮周圍有沒有嚴重的工廠或其他的企業汙染；

5、營養情況，妊娠反應較重，進食不佳，吐得較厲害，或者吃的方法不對，營養不均衡，這種情況也會影響孩子發育；

6、藥物影響，如感冒或者其他原因吃藥物，不知道懷孕而吃藥物均會影響。