肝動脈栓塞術後併發症主要包括局部穿刺部位的疼痛、出血、感染以及栓塞術後出現的肝功能受損、肝臟壞死，合併嚴重的細菌性感染、肝膿腫。嚴重時，患者還會出現肝功能衰竭等。另外，患者也會出現疼痛、噁心、嘔吐、乏力以及食慾不振等表現。

肝動脈栓塞、化療可用於治療原發性肝癌，原發性肝癌中晚期患者可以通過介入治療以獲得延長生存，但也可能帶來不良反應。因為栓塞會堵塞腫瘤的血管，引起腫瘤的壞死。若患者合併感染，則會出現明顯的寒戰、發熱，而化療藥物會帶來藥物的相關不良反應，包括消化不良、噁心嘔吐、乏力、白細胞減少及血小板降低等。此外，化療藥物以及栓塞劑也會對肝臟功能造成影響，嚴重時甚至會誘發急性肝功能衰竭。