絕大多數嬰兒的發熱驚厥很少留有後遺症，只有極少數的發熱驚厥會造成一些後遺症，兒童發熱驚厥的後遺症主要有以下幾點：

首先，引起疲勞，因為在發熱驚厥的時候全身的骨骼肌就會痙攣，從而造成兒童的疲勞感非常明顯，會表現為嗜睡、乏力。

其次，會引起大腦的損傷，如果發熱驚厥持續的時間超過了5分鐘，往往會引起兒童的大腦受到一定程度的損傷，這個時候會出現頭暈、頭痛。