肛裂能否自愈，需根據肛裂嚴重程度如早期肛裂或已經發展到陳舊性肛裂，以及引起肛裂的誘發因素是否被去除進行綜合判斷。早期肛裂多數原因是大便乾燥，數天不排便，排粗硬的大便，從而將肛門皮膚撐破。另一個原因是肛門相對狹窄，肛門內括約肌受不良刺激後形成痙攣，如果痙攣持續不緩解，發生增厚，進而造成肛門相對狹窄。

治癒肛裂需通過調理飲食，調理大便習慣，每天定時排軟便，減少對肛門的不良刺激。排便後需及時溫水坐浴以放鬆肛門肌肉，包括肛門括約肌，達到加快局部血液循環的目的，同時局部塗抹藥膏。經過系統治療，早期肛裂多數可以治癒。肛裂反覆發作的原因是便秘因素的存在，由於大便乾燥對裂口反覆刺激，裂口老化且越來越深，刺激肛門內括約肌，最終引起肛門狹窄。肛門狹窄一旦形成，肛裂則難以治癒，需通過手術的方式才能徹底治癒。