促進肛裂癒合的藥物主要是軟膏類藥物，常用的有銀離子凝膠如痔瘡凝膠，可以促進肛裂的癒合，因為銀離子具有殺菌的作用。還有成纖維細胞生長因子的凝膠或軟膏，也可以促進肛裂的癒合，還可以用複方多粘菌素B軟膏，對創面的癒合也有好處，還有生肌軟膏、太寧軟膏、馬應龍痔瘡膏等對治療肛裂癒合也有一定好處。

此外促進肛裂癒合，除需塗藥膏外，還要去除肛裂的原因。如果有便秘便糾正便秘，如果有肛門括約肌痙攣，需要先在肛門周圍肌肉注射肉毒素，緩解肛門痙攣後肛裂才能癒合。