直腸息肉引起的不適包括疼痛和墜脹感，另外，還會引起便血，但並不屬於一種不適，而是一種症狀。息肉較小時可能患者沒有任何表現，不會疼痛、不會出血，也不會有墜脹感。

部分息肉為功能性息肉，可能會引起排便功能改變，如排便次數增多，大便較稀軟或水樣便。部分息肉會分泌黏液，造成大便中黏液增多，屬於異常表現，甚至有時出現腹瀉，而息肉較大也可能會造成疼痛。