直腸脫垂病因尚未明確，經研究可與以下因素有關：
1、解剖因素：兒童患者直腸垂直度較成人垂直，當腹內壓增高時，直腸缺乏有力支撐而導致直腸脫垂。部分女性多因分娩次數過多或分娩過程中，會陰撕裂導致支撐結構破壞，引起直腸脫垂；
2、腹內壓增高：主要見於長期便秘、咳嗽，老年男性前列腺增生，此類患者因長期腹內壓增高壓迫直腸向下移位，亦形成直腸脫垂；
3、神經因素：伴有神經系統疾病的患者，直腸脫垂發病率較高；
4、手術、外傷：引起肛門局部結構損傷，導致肛門周圍肌肉支持功能減弱，形成直腸脫垂。