器官移植是將不是自己的器官植入體內，體內會發生排斥過程，即排除異己的過程。主要機制為免疫系統識別異體抗原，抗原意識到免疫系統發生了抗原抗體反應，即排斥反應。若是同卵雙生的供體，則不會發生排斥反應，因為基因組完全相同，相當於認為自己的器官，不會發生排斥反應。只要不是完全基因組相同的器官植入到體內，都會發生排斥反應。排斥反應以皮膚移植的排斥反應最為劇烈，其次為腎臟移植，排斥反應也發生較多。肝臟相當於免疫豁免的器官，肝移植髮生排斥反應的可能性相對較小。