肝臟移植之後出現排斥反應屬於肝移植術後較常見的一種合併症。既然移植的器官不是來自於自己，排斥反應如果不使用抗排斥藥物是不可避免的。根據排斥反應發生的時間分為急性排斥反應和慢性排斥反應。

急性排斥反應是指在移植術後半年或者是一年之內出現的，以膽管細胞和血管內皮受損為特徵，這樣的肝細胞受損的情況，表現是肝功能異常，可以出現轉氨酶的升高，也可以出現膽紅素升高。這種排斥反應可以通過肝臟穿刺或者通過監測抗排斥藥物的濃度進行診斷。如果急性排斥反應診斷及時，通過調整抗排斥藥物的使用，完全可以獲得逆轉。慢性排斥反應是指移植術後長期出現的以膽管消失為特徵的肝功能受損表現。慢性排斥反應目前仍然沒有特別好的治療方法，往往慢性排斥反應，嚴重的需要再次進行肝臟移植。