肝移植是移植其他人體的完整器官，人體有組織相容性抗原和其它抗原，對於不是自己的任何組織，如細菌、細胞都有排斥反應，輸血其實也有一定的排斥反應，如果ABO血型相符，排斥反應低，在可接受範圍之內。
如果不予控制排斥反應，移植完整器官會引起嚴重的排異反應。隨著現代各種抗排異藥物的發明和發展，現在肝移植術後排異基本已經解決，所以現在肝移植術後長期生存20年、30年甚至40年的病例存在，所以移植反應已經完全解決。但是需要注意，抗排異藥不夠停，一旦停用抗排異藥物同樣會出現嚴重的排異反應，所以肝移植術後終身服用。