腎移植是一個器官移植，從供者移植器官到受者身上，所以它最常見的不良反應就是排斥反應。排斥反應是人體為了保護自己機體的一種常見的免疫功能，它並不知道供者的器官是來幫助自己工作的，但對於免疫系統來講，它就是一個外物，所以我們需要用免疫抑制劑控制排斥反應。但是我們用免疫抑制劑，必然又帶來第二個不良反應的可能性，感染。所以腎移植術後近期感染的發生率會比較高，可能會有細菌、真菌、衣原體、病毒、卡氏肺孢子蟲等感染。有一部分感染會引起嚴重的間質性肺炎，出現低氧血癥，乃至有生命危險。