甲狀腺囊腫和甲狀腺結節在臨床診斷上是兩個不同的稱呼，甲狀腺結節可為囊性或實性結節，而甲狀腺囊腫為囊性的結節，內部是液體類的物質。因此甲狀腺囊腫大多是良性病變，而甲狀腺結節有可能為惡性或其它的實性良性腫瘤。大多通過超聲進行甲狀腺的腫物判斷具體部位、是否有血運、鈣化等影像特徵。

由於超聲對實性和液性的組織有較高的區分度，如果明確為低迴聲或無回聲，尤其是無回聲，基本可以判定腫物是囊性病變。對於囊性腫物，通過超聲可以很明確的區分。由於囊性病變大多是良性，在處理時只要囊腫較大，產生一定的壓迫症狀，可以通過手術進行切除。對於實性結節也可以根據腫物的大小及是否有惡變傾向，選擇是否需要進行手術切除。